О Пустынно-Николаевском монастыре на Аскольдовой могиле в первый раз упоминается в послесловии к Евангелию 1411 года и в отказной грамоте 1427 года. С этого периода по разным актам (грамоты, завещания, купля-продажа) монастырь не один раз приобретал имущество. К концу XVI века он обладал необъятными угодьями. Очень пострадал во время унии. В 1518 году Киево-Печерский монастырь уступил Пустынно-Николаевскому монастырю урочище Долгую ниву. В 1682 году в нём уже находилась слобода и в конце XVII века в неё был перенесен сам монастырь. На прежнем месте монастыря осталось его кладбище, с приписной церковью Святителя Николая.
В 1690 году гетман Мазепа на новеньком месте выстроил для монастыря соборную церковь. В 1831 году она была переименована в Никольский военный собор, кельи были обращены в казармы, а братия была переведена в новопостроенную церковь Святого Николая Малого, либо Слупского.
Разрушен в русское время.
